Rin ist die Tochter der großen Tohsaka-Magierfamilie. Als sie klein war, nahm ihr Vater am Krieg teil und starb. Ihre Mutter war dadurch psychisch total am Ende und starb auch bald darauf. Rin trainierte all die Jahre hart um den Gral zu gewinnen und endlich alles zu beenden.

Sakura ist eigentlich Rins biologische Schwester, doch Tokiomi, Rins Vater, gab Sakura damals an die Matou-Familie, da nur ein Kind sein Nachfolger werden konnte. Seit dem hat Rin eine schwere Beziehung zu Sakura.